Sezon 1 odcinek 13 ,, Samiec Alfa ''

10 września, Północne Indie
Burmistrz Gotham, Hamilton Hill wraz z dwoma innymi łowcami podążają śladem tygrysa indyjskiego. Jest tak pewny siebie, że kpi z ostrzeżeń, które słyszał przed wyprawą. W końcu dociera na skraj polany i dostrzega zwierzynę siedzącą na drzewie. Kiedy tygrys rusza w ich stronę zostaje schwytany w pułapkę, co postanawia wykorzystać Hill. Niestety mężczyźni muszą uciekać, kiedy zza drzewa wychodzi ogromny goryl i zaczyna do nich strzelać...
23 września, Mount Justice
Członkowie Justice League pomagają w odbudowie kryjówki, ale Young Justice zamiast pomagać, bardziej chcieliby uzyskać informację o ostatnich wydarzeniach. Superboy podsłuchuje rozmowę Batmana z Aqualadem i dowiaduje się, że przyjaciel wiedział o szpiegu. Od razu to ujawnia, co wywołuje wściekłość pozostałych członków. Batman przerywa kłótnie i wprowadza zmiany. Drużyna będzie nadzorowana przez kilku opiekunów, a na pierwszego chętnego zgłosił się Kapitan Marvel. Mroczny Rycerz informuje ich także, że sprawą Red Tornado zajmie się Justice League. Young Justice ma się zająć zaś sprawą goryla o pseudonimie Monsieur Mallah, który zaatakował burmistrza Gotham. Wraz z drużyną wyrusza Kapitan Marvel.
23 września, Północne Indie
Robin i Kid Flash podważają pozycję Aqualada, bowiem złamał on podstawową zasadę, jaka była fundamentem grupy: żadnych tajemnic. Również Superboy za punkt honoru postawił sobie to, aby Megan była bezpieczna, co nie do końca odpowiada dziewczynie. Drużyna jest kompletnie rozbita, co szybko zauważa Kaptain Marvel.

Śladami superbohaterów podążają zwierzęta, które mają za zadanie ich śledzić. Aqualad i Kapitan Marvel stają oko w oko z potężnymi słoniami indyjskimi, które od razu ich atakują. Podobnie Kid Flash i Robin muszą zmierzyć się z sępami, Superboy z wilkami, a dziewczyny z aligatorem. Wszystkie zwierzęta kontrolowane są przez specjalne obroże. Aqualad niszczy jedno z urządzeń, dzięki czemu poraniony słoń od razu się uspokaja i odchodzi. Niestety nie udaje mu się skontaktować z drużyną, aby sprawdzić ich status. Kapitan Marvel poucza go o błędach, jakich nie powinien popełniać przywódca oraz daje za wzór do naśladowania postawę Batmana.
Miss Martian kontaktuje się z Aqualadem i informuje go, że takie obroże widziała już w Belle Reve. W tym czasie Kapitan Marvel podąża za tygrysem, którego zauważył. Chcąc zdjąć mu obroże, wpada w zastawioną na niego pułapkę. Okazuje się, że atakami stoi Monsieur Mallah.
Aqualad kontaktuje się z drużyną, ale ci tylko skupiają się na ostatnich wydarzeniach zamiast na misji. Kaldur znajduje ślady goryla i zaprowadza porządek w Young Justice.
Kapitan Marvel trafił na stół laboratoryjny, ponieważ Brain, postać, dla której pracował Mallah, chciał się przyjrzeć funkcjonowaniu mocy superbohatera. Drużyna dociera do bazy, gdzie przetrzymywany jest przyjaciel i wspólnie przystępują do działania. Niestety muszą się zmierzyć z oddziałem zwierząt wysłanym przeciwko nim, a także samym Mallahem. Brain przystępuje do procesu usunięcia mózgu Kapitana Marvela, ale procedura zostaje przerwana przez tygrysa, któremu superbohater chciał wcześniej pomóc. Young Justice wkracza do sali, a Kid Flash od razu rozpoznaje znajomego przestępcę. Po krótkiej walce udaje im się uwolnić Kapitana Marvela, ale Brain i Mallah uciekają. Kid Flash na pamiątkę zabiera czapkę goryla. Megan i Conner wyjaśniają sobie kilka spraw dotyczących ich związku, a do drużyny dołącza wilk, który zaatakował Superboy'a (dostaje imię Wolf). Aqualad wyjaśnia Young Justice motywy swojego postępowania, dzięki czemu umacnia swoją pozycję jako lider.
24 września, Fawcett City
Kapitan Marvel wraca do domu, gdzie opowiada wujkowi o przygodzie z Young Justice. Na jego prośbę powraca do swojej chłopięcej postaci i idzie spać.

Sezon 1 odcinek 12 ,, Wróg wewnętrzny ''

22 września, Gotham City
Artemis wstaje z samego rana i patrząc na plakat przypomina sobie dzień odejścia jej siostry. Dla dziewczyny jest to także pierwszy dzień w Gotham Academy. Gdy jest na miejscu, od razu podbiega do niej chłopak, który robi jej zdjęcie. Jest to Dick Grayson, lecz Artemis nie ma pojęcia, że zna go już od dawna – jako Robina.
22 września, Mount Justice
Pocałunek Megan i Superboy'a przerywa Sphere, który ostrzega ich o przybyciu Kid Flasha. W tym czasie Aqualad rozmawia z Red Tornado o szpiegu, który jest w drużynie. Postanawia jednak samemu przyjrzeć się tej sprawie, a utwierdza go w tym także przełożony, który mówi mu, co powiedziałby Batman w takiej sytuacji.
22 września, Gotham City
Robin wypytuje Artemis o to, co robi w Gotham, kiedy wspólnie korzystają z przejścia do Mount Justice. Gdy docierają na miejsce muszą zmierzyć się z nieznanym im wrogiem.
22 września, Mount Justice
Robin szybko odkrywa, że nie dadzą rady nowemu zagrożeniu, zwłaszcza, że są atakowani dwoma żywiołami – wodą i ogniem. Nie udaje mu się także nawiązać kontaktu z drużyną, ani z Justice League. Ostatecznie docierają do kuchni, gdzie chowają się w przewodach wentylacyjnych.  Dzięki nim docierają do pomieszczenia energetycznego, lecz ich tropem rusza ognisty przestępca. Kiedy w końcu są bezpieczni, Robin dostaje się do systemu i ogląda nagrania z jaskini. Na jednym z nich Aqualad wypytuje drużynę o Artemis, ale Kid Flash jest pewny, że pomimo rozpoczęcia szkoły, ta na pewno poradzi sobie z zachowaniem lojalności. Niestety rozmowę przerywa wybuch, ale Robinowi nie udaje się ustalić, co go spowodowało.
Para dociera do biblioteki, ale i tam ktoś wchodzi. Artemis rozpoznaje po głosie Red Tornado, jednak okazuje się to być zwykłą sztuczką. Zamiast tego staje oko w oko z maszyną, która bardzo go przypomina. Co więcej okazuje się, że przeciwników jest dwójka. Na szczęście bohaterom udaje się uciec.
Przestępcy dają im 10 minut na poddanie się, inaczej pozostali członkowie Young Justice zginą. W trakcie ucieczki Artemis zostaje pojmana przez jednego z robotów, ale Robin wyciąga ją z opresji. Docierają do hangaru, lecz zostają zepchnięci w ślepy zaułek chcąc pomóc w uwolnieniu przyjaciół. Po nieudanej misji wycofują się, niestet do końca czasu pozostaje tylko 6 minut. Robin stara się uspokoić Artemis, ale ta zaczyna panikować. Bohater kontaktuje się z Kid Flashem za pomocą nadajnika, który umieścił przy jego głowie i wspólnie konstruują bombę z impulsem elektromagnetycznym. Niestety, aby mogła zadziałać, potrzebne jest dodatkowe zasilanie. Kid Flash i Superboy rozpraszają przeciwników tak, aby Robin mógł podłączyć urządzenie. Niestety zostaje zauważony, a Artemis chcąc mu pomóc marnuje swoją ostatnią strzałę.

Dziewczyna zaczyna panikować, zwłaszcza, że jej przyjaciołom grozi śmierć. Początkowo chce się poddać, ale ostatecznie postanawia sprowadzić pomoc. Niestety czasu jest za mało. Dostaje się do pokoju, gdzie znajduje pamiątki gromadzone przez Kid Flasha. Wśród nich jest maska Cheshire, która jak się okazuje należy do... jej siostry. To właśnie w dniu ucieczki postanowiła ona zniknąć niczym Kot z Cheshire z bajki "Alicja w Krainie Czarów". Artemis postanawia nie dopuścić do tego, aby jej nowa rodzina ucierpiała.

Bohaterka oddaje się w ręce swoich przeciwników, ale szybko okazuje się, że jest to podstęp. Używa strzały znalezionej na półce z pamiątkami i zamyka obwód, aktywując tym samym bombę. Impuls elektromagnetyczny dezaktywuje wszystkie urządzenia, w tym i przestępców. Young Justice zostają uratowani.
W Mount Justice zjawia się Red Tornado, który oznajmia bohaterom, że nie wiedział, iż ma jakiś krewnych. Swoją nieobecność usprawiedliwia pobytem w Strażnicy. Po zerwaniu komunikacji postanowił zbadać tę sprawę, ale zajęło mu to więcej czasu niż przewidywał. Kiedy impuls się wyczerpał, Red Tornado przejął świadomość jednego z przestępców i zaatakował Young Justice, doprowadzając członków drużyny do utraty przytomności.
Po jakimś czasie na miejscu odnalazła ich Justice League. Artemis oznajmiła, że Red Tornado jest zdrajcą, który zabrał ze sobą dwa pozostałe roboty.

---

Sezon 1 odcinek 11 ,, Terroryści''

14 września, Nowy Orlean
Cat Grant relacjonuje na żywo pojedynek Terror Twins z Supermanem i Marsjaninem Manhunterem. Walka kończy się pojmaniem przestępców. Na miejscu zjawia się Megan wraz z Superboy’em w niecodziennej charakteryzacji. Dziewczyna przejmuje wygląd swojej przeciwniczki, po czym Batman oznajmia , że od teraz młodzi bohaterowie są aresztowani.
16 września, okolice Belle Reve
Więźniowie transportowani są do zakładu razem z Mr. Freeze oraz Iciclem Juniorem. Megan przypomina sobie jak zostało im przydzielone zadanie zbadania tego, co jest planowane w Belle Reve. Batman podejrzewał bowiem, że to nie przypadek, że grupa więźniów, z którymi ostatnio walczyli, trafiła właśnie tam. Więźniowie zostają przetransportowani na plac główny, gdzie wita ich Amanda Waller – naczelnik więzienia. Obroże zmontowane na ich szyjach służą nie tylko namierzaniu, ale i za ich pomocą mogą zostać wymierzane kary. Waller przedstawia także profesora Hugo Strange’a, więziennego psychiatrę.
Conner i Icicle zostają umieszczeni w jednej celi, a Megan trafia do Killer Frost. Następnego dnia Icicle Junior poczuwa się wyjaśnić nowemu przyjacielowi kto rządzi w Belle Reve. Wśród najważniejszych osób jest między innymi jego ojciec. Kiedy Icicle Junior zostaje zaatakowany przez Profesora Ojo, w pomieszczeniu wywiązuje się bójka, podczas której o mały włos nie wychodzi na jaw prawdziwa tożsamość Terrora. Na szczęście w porę ingeruje Megan. Więźniowie, już w komplecie, postanawiają przejąć władzę nad Belle Reve.

Miss Martian przez cały czas pozostaje w kontakcie z Aqualadem, ale para nie chce przerwać swojej misji, pomimo nalegań przyjaciela. Potrzebne im są bowiem dowody, że akcja ma się rozpocząć niebawem. Rodzeństwo Terror trafia na sesję do Strange’a. Megan opowiada profesorowi o problemach Superboy’a, co zaczyna denerwować Connera. Tymczasem w pralni Mr. Freeze wraz z pozostałymi przestępcami zabiera niezbędne narzędzia do realizacji planu. Wszystko trzymane jest w ścisłej tajemnicy. Nie podoba się to Riddlerowi, który na każdym kroku jest odtrącany od „przywódców”.
Icicle Junior wypytuje Superboy’a o jego „siostrę”. W tym czasie dochodzi do kłótni między więźniami, po której porażony prądem Mr. Freeze zostaje zabrany. Icicle Senior musi się z nim skontaktować, więc swoją pomoc oferuje rodzeństwo Terror. Mr. Freeze pozbywa się obroży i atakuje Amandę Waller. Pani naczelnik od razu zamyka więzienie, lecz to nie powstrzymuje przestępcy przed wykonaniem zadania. Dezaktywuje wszystkie obroże i w Belle Reve od razu wybucha bunt. Megan nie może stać z boku i postanawia ocalić jedną z policjantek, przez co wpada w kłopoty. Lodowi przestępcy wykorzystują swoje moce, aby rozbić mury więzienia, co ma zapewnić im drogę ucieczki. Conner podpuszcza Icicle Juniora i z jego pomocą dostaje się do centrum dowodzenia. Aktywuje na nowo obroże, przez co część więźniów zostaje porażona prądem. Icicle Senior wpada w szał i atakuje Waller, lecz w jej obronie staje Hugo Strange. Superboy ponownie podpuszcza swojego „nowego przyjaciela”, który buntuje się przeciwko Mr. Freeze’owi. Conner dostaje się w końcu do części dla kobiet, ale jest za późno. Megan została bowiem uwięziona w lodzie. Superboy prosi ją, aby go nie opuszczała. Chce rozbić lód, ale Icicle ostrzega go, że to może ją zabić. Miss Martian niszczy pokrywę od wewnątrz i wpada w ramiona przyjaciela. Chce wytłumaczyć Superboy’owi, że na Marsie żyją w o wiele niższych temperaturach, ale ten przerywa jej wypowiedź pocałunkiem. Icicle uświadamia sobie, że został wykorzystany przeciwko swojemu ojcu.
Amanda Waller zostaje zwolniona, a posadę naczelnika Belle Reve dostaje Hugo Strange. W czasie buntu udało się uciec tylko jednej osobie – Riddlerowi. Na jaw wychodzi, że profesor od samego początku współpracował z Icicle Seniorem. A wszystko po to, aby wzmocnić pozycję Światła.

---

Sezon 1 odcinek 10 ,, Ukryty Cel ''

7 września, Taipei
Cat Grant relacjonuje złamanie traktatu pokojowego między Północną a Południową Rhelasią. Generał Singh Manh Li postanowił sprowadzić mediatora, więc wszyscy zaczęli się zastanawiać kim on może być. W Taipei obecny był także Red Arrow, który skontaktował się z Aqualadem, aby uzyskać informacje na temat Cheshire. Bał się bowiem, że Liga Cieni może zakłócić mediacje między krajami. Kiedy przybyła oczekiwana osoba, przestępczyni wkroczyła do akcji, ale Red Arrow zdołał ją powstrzymać swoją strzałą. Cheshire rzuciła się na niego, ale szybko została pojmana przez policję. Media szybko zmieniły temat zainteresowania, bowiem mediatorem okazał się być Lex Luthor.
Miliarder wstawił się za swoim wybawcą, co nie do końca podobało się Red Arrow. Zapowiedział, że będzie go obserwował, bowiem nie wierzy w jego intencje. Przywódcy krajów zaczęli się wzajemnie oskarżać o zamach, co nie przyczyniło się do poprawy relacji między nimi. Red Arrow zarzucił Luthorowi wspieranie obu krajach w ich wyścigu zbrojeń. Postanowił jednak pozostać w pobliżu, aby dowiedzieć się na czyjej śmierci tak naprawdę zależało Lidze Cieni.
7 września, Mount Justice
Superboy od ostatnich wydarzeń zaprzyjaźnił się ze Sphere. W garażu, gdzie przebywał, zjawili się także Aqualad, Marsjanin Manhunter, Red Tornado i Aqualad. Dla Miss Martian i Superboy'a miał być to pierwszy dzień w szkole.  Chłopak przyjął dla siebie imię Conner Kent i po zmianie stroju wspólnie wyruszyli na zajęcia.
 7 września, Taipei
Red Arrow udał się do więzienia, aby przesłuchać Cheshire. Ta jednak nie chciała nic mu zdradzić. Skupiła się za to na nieobecności Young Justice, a zwłaszcza Artemis. Red Arrow dał się podejść, więc Cheshire wykorzystała okazję i uciekła wspólnie ze Sportsmasterem, który po nią przybył. Bohater ruszył za nimi, ale linę, do której był przyczepiony, przecięła jego przeciwniczka. Nie pozbyła się jednak pozostałości po strzale, która okazała się mieć w sobie nadajnik. Udał się za sygnałem i dotarł do miejsca, w którym odkrył, że za wszystkim stoi Ra's al Ghul. Ten jednak szybko zorientował się, że są obserwowani. Wysłał przeciwko bohaterowi Cheshire i Sportsmastera. Pojedynek zakończył się, kiedy Red Arrow stracił swój oręż i musiał uciekać. Poinformował Luthora o tym kto stał za zamachem. Miliarder jednak się tym nie przejął.
7 września, Happy Harbour
Conner musiał odnaleźć się w nowej rzeczywistości, gdzie wszyscy byli fanami superbohaterów. Para przyjaciół od razu znalazła sobie zarówno znajomych jak i wrogów. Megan dostała zaproszenie na trening cheerleaderek od Wendy Harris. Temat rozmów pokojowych w Rhelasii został także poruszony na jednej z lekcji, ale młodzież nie za bardzo się orientowała. Dopiero Conner opowiedział o historii dwóch krajów, ale nie mógł zrozumieć, dlaczego ludzie ze sobą walczą. Megan wytłumaczyła mu, że podobnie jest na Marsie, gdzie biała mniejszość jest uciskana przez zieloną większość.
7 września, Taipei
Lex Luthor przewodniczył rozmowom między dwoma krajami. Na sali był także obecny Aqualad, z którym skontaktował się Red Arrow prosząc o pomoc. Członek Young Justice od razu rozpoznał Cheshire w przebraniu. Doszło do eksplozji, ale Aqualad zdołał ochronić gości za pomocą wodnej zasłony. Do akcji wkroczył także Sportsmaster ze swoimi ludźmi. Całej sytuacji uważnie przyglądał się Lex Luthor.

7 września, Happy Harbour
Conner został po lekcjach, aby przyjrzeć się jak Megan stara sie dostać do drużyny. Po występie dziewczyny wylały na nią kubeł wody, co Superboy odebrał jako atak. Okazało się jednak, że jest to głupi zwyczaj, który musi przejść każda nowo przyjęta kandydatka. Cheerleaderki od razu zainteresowały się jej przyjacielem, chcąc wiedzieć, czy spotykają się ze sobą.
7 września, Taipei
Podczas pojedynku ze Sportsmanem, Aqualad dowiedział się od niego, że przestępca wie o wszystkich ostatnich akcjach drużyny. Wytłumaczył to tym, że ma swoje bardzo dobre źródło. Red Arrow rozbił spryskiwacze, dzięki czemu wzmocnił moc swojego przyjaciela. Wygrana była po ich stronie, jednak jeden z zabójców przedarł się w stronę Lexa. Obroniła go Mercy, która okazała się być cyborgiem. Zaimponowało to obu przywódcom. Luthor doprowadził rozmowy pokojowe do końca. Red Arrow i Aqualad zaczęli się zastanawiać nad potencjalnym szpiegiem w drużynie, jednak Kaldur nie chciał od razu ferować wyroków. Dlatego też postanowił przeprowadzić śledztwo. Przyjaciele obiecali ze sobą współpracować.
Lex Luthor w swoim gabinecie opowiedział o wszystkim Ra's al Ghulowi. Okazało się , że obaj panowie należą do Światła.